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NGSサンプル調製

自動ライブラリ調製、品質管理およびプーリング

1週間に数サンプルから、1日に数百サンプルまで、NGSサンプル調製の自動化で、信頼性の高い次世代シーケンシング用の高品質ライブラリを再現性高く作製できます。

Fluent limited offer - click here!




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Tab 01 / HTP NGSサンプル調製
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DreamPrep™ NGS: NGSライブラリ調製と品質管理における完全自動化ソリューション

自動化機器とNGS試薬キットを組み合わせることにより、NGSライブラリ調製および品質管理のための完全に最適化されたソリューションを提供しています。Fluent、Infinite®プレートリーダーと革新的なライブラリ調製キットを組み合わせることで、完全自動化が可能となり、研究の効率化やコスト削減を実現します。

NGS DreamPrepワークステーションは、NuQuant® Library Quantification法およびシーケンシングデータからの不要な読み取りのAnyDeplete介在性転写物喪失を含む、Celero™およびUniversal Plus試薬のための模範法*と共に実現しています。NuQuantの統合は、NGSサンプルからシーケンシングのための正規ライブラリの調製まで、完全自動化ソリューションを可能にします。

DreamPrep NGS は、以下によってライブラリ調製ワークフローを変容します:

  • スループット向上とコスト削減のための革新的なTecan Genomics試薬キット
  • サンプルのロスなく数分以内でQCチェックが終了
  • DNA-Seq用Addition Onlyワークフロー
  • 自動化、試薬、消耗品、アプリケーションサポートまでトータルソリューションを提供
  • ニーズに合わせてカスタマイズ可能な使いやすいタッチスクリーン式インターフェース

 

* DreamPrepのメソッドは、一部を除き、お客様のワークフローとご要望のメソッドおよび検査プロトコルに基づいて、検査室でバリデーションを行っていただく必要があります。メソッド例の性能に関してはTecanは保証を行うものではありません。

 

Free Download The benefits of automated DNA library preparation

DreamPrep™ NGS: NGSライブラリ調製と品質管理における完全自動化ソリューション

 

Fluent Laboratory Automation Solution

急速な技術の進展により、NGSは、多くのアプリケーションにおいてPCRまたはアレイベースに代わる費用効果の高いメソッドとして、1回のシーケンシング実行で数百のサンプルのプーリングを可能にしています。Fluentの高速性、正確性および精度により、96ウェルまたは384ウェルプレートからのNGSライブラリ調製に最適です。

 

導入のメリット

  • 単純な操作でユーザーインターフェースをカスタマイズし、関連するオプションだけを表示可能
  • 処理のばらつきを低減する高精度ピペッティングにより、オペレーター間および時間の経過に伴う再現性を向上

Fluentハイライト

インテグレーション用オプション

ビーズ式NAPのための磁気分離およびPCRクリーンアップ

DNA定量化およびノーマライゼーション

加温および冷却機能付きインキュベーション

フィルター式精製フォーマットの真空分離

サンプルトラッキングとバーコードスキャン

サーモサイクラー

直観操作

ビルトインタッチスクリーンインターフェースにより、毎日のタスクをガイドして、高速で一貫した操作を実現します。メソッドのアクセス許可を含む統合ユーザー管理が、安全なプロトコルを確保し、各ユーザーの選択を最適化します。

迅速で、より正確に

独立した3本のアームが同時並行で複数の処理を進めます。サンプル調製、実験機器の周辺機器への、およびプレート間の移動、または試薬追加を並列して実施することで、パフォーマンスを最大化します。

試薬やサンプルの使用量を節約

新世代の液面感知システムAdaptive Signal Technology™が、リアルタイムの吸引モニタリングと、吐出後の液量チェックを可能にし、微量分注の正確性、デッドボリュームの低減に寄与します。

Method Approval

Method Approval機能によりバリデーション済みプロトコルへの未承認の変更を防止します。オペレーターにより何らかの変更が行われると、キーオペレーターがその変更を承認するまで、実行ができなくなります。

サードパーティーデバイスのインテグレーション

FluentControl™は、SiLAデバイスのサポートも含め、ドライバの増え続けるライブラリ、およびセットアップを簡素化するZero-Gワンタッチティーチングにより、サードパーティーデバイスの簡便なインテグレーションを提供します。

Tecan製消耗品により生産性を強化

Tecanは、ディスポーザブルチップからトラフまで、高品質な消耗品の幅広いポートフォリオをTecan Standard、Tecan Pureおよび Tecan SterileのPurityレベルで提供します。すべての製品は、信頼性の高い自動化を確保するために厳格な検査を実施しています。




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Tab 02 / 検証済NGSプロトコル
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Illumina qualified protocols

Tecanは、主要研究センターおよびIlluminaと共同して、NGS用サンプル調製プロトコルの自動化の開発と最適化を行っています。あらゆるラボでプロトコルが確実に行われるように検証を行っています。

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TruSeq Nano DNA

TruSeq Nano DNAサンプル調製キットは、利用可能なDNAの量が限定されたサンプルの効果的な調査を可能にします。Freedom EVO® NGSワークステーション上のこのキット自動ワークフローは、シンプルなビーズ式のサイズ選択を含み、48までのサンプルを最小限の実作業時間で1日かからずに完了できます。

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TruSeq PCR Free

TruSeq DNA PCRフリーサンプル調製キットは、DNAサンプル調査で時間を削減します。ユーザーにとって使いやすいTouchTools™インターフェースは、自動設定から再現性が高く、1回での読み取り用にすぐにシーケンシングを実施できるDNAライブラリ、ペアエンドおよびインデックス付加済みシーケンシングまで、最小限のユーザーによる介入でオペレーターを導きます。

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Nextera XT

Nextera XT DNAライブラリ調製キットは、わずか1 ngからのDNAインプットのために最適化されたプロトコルを使用して、PCR amplicons、プラスミドおよびサイズの小さいゲノムから高品質のライブラリを効果的に構成できます。

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TruSeq Stranded mRNA

RNAシーケンシング(RNA-Seq)は、RNA転写を探知、プロファイリングおよび定量する強力な方法です。Illumina次世代シーケンシングテクノロジーを利用して、鎖遺伝子情報が特定のRNA転写が由来するDNA鎖を特定し、転写アノテーションへの信頼性を高め、アンチセンス制御に視認性を提供します。

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TruSeq Stranded Total RNA

Freedom EVO NGSワークステーション上でのIllumina TruSeq Stranded Total RNAプロトコルの自動化は、最小限のユーザーによる介入で総RNAを既知の鎖開始点のテンプレート分子のライブラリに変換可能にします。Freedom EVO NGSワークステーションは、最小限のクロスコンタミネーションリスクで高品質のライブラリを実現します。

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TruSeq RNA Access

TruSeq RNA Accessライブラリ調製プロトコルは、アーカイブ用ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織サンプルの費用効果の高いシーケンシングに最適なソリューションです。統合型濃縮ステップは、DNAの低濃度での開始に対応し、自動化ワークフローは並列で48までのライブラリを構築すると共に、限られたユーザーによる介入と最小限のクロスコンタミネーションのリスクで高品質のライブラリを生成します。

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Nextera Rapid Capture

Nextera Rapid CaptureプロトコルとFreedom EVO NGSワークステーションの組み合わせによる自動化しやすいワークフローは、ライブラリ調製とエクソーム濃縮のための高速で効率の良いソリューションを提供します。自動化されたNextera Rapid Capture Exomeプロトコルの使用により、サンプル調製は最小限の実作業時間でわずか1日半で完了でき、翌日にはシーケンシングデータの結果を生成します。

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TruSight® HLA v2.0 Sequencing Panel

血清型分析などの従来のテクニックと比較して、組織ドナーおよびレシピエントのHLAプロファイルの測定に優れているため、HLA遺伝子シーケンシングへの関心が高まっています。

Illumina TruSight HLA v2.0 Sequencing Panelは、HLAプロファイリング用のNGSライブラリを生成するために設計された信頼性が高くシンプルなアッセイです。Freedom EVO NGSワークステーション上でのワークフローの自動化は、24までのサンプルの11のHLA遺伝子座のシーケンシングを実現し、ライブラリ調製中のクロスコンタミネーションとヒューマンエラーのリスクを最小化します。

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TruSeq ® Custom Amplicon Low Input

Ampliconシーケンシングは、特定のゲノム領域における変異の同定および分析用のターゲット法です。PCR製品のシーケンシングは、費用効果の高い変異型の同定とキャラクタリゼーションを提供します。Freedom EVO NGSワークステーション上でのTruSeq Custom Amplicon Low Inputライブラリ調製ワークフローの自動化は、高速で効率的なソリューションを提供します。この設定により、わずか10 ngのゲノムDNAといったlow inputサンプルから高品質のライブラリを生成することができます。

Verified for Illumina sequencing

Tecanは、シーケンシング結果の分析に集中する時間を持てるよう、NGSサンプル調製キットのベンダーと共同でNGSサンプル調製プロトコルを開発、検査およびシーケンシング検証しました。

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NEBNext Ultra II Directional RNA

Illumina用NEBNext Ultra II Directional RNAライブラリ調製キットは、「dUTP」を使用して優れたリカバリー率を確保し、低品質のRNAからでさえ高品質のDirectionalライブラリを生成します。poly(A) mRNA濃縮には10 ng~1 µgのtotal RNA、rRNA除去には5 ng~1 µgと、幅広いインプット材料から96までのライブラリが同時に調製できます。

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NEBNext Ultra II DNA

NEBNext Ultra II DNAライブラリ調製ワークフローは、エンドリペアとdAテーリングステップを最小限のクリーンアップと組み合わせ、サンプル調製時間を削減します。Illumina用NEBNext Multiplex Oligosでは、たとえば、1回の運転で96までのライブラリを調製できます。

このプロトコルにより、多様な500 pg~1 μgのインプットDNA濃度とFFPEサンプルからの再現性の高いライブラリ調製を可能にし, 最小限のユーザーによる介入で1~96サンプルの柔軟な処理を実現します。

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SureSelect XT Target Enrichment

AgilentのSureSelect XT Target Enrichment Systemは、ヒトおよびその他の種用エクソームキット、DNAおよびRNA両方のキャプチャー用カスタムキットの完全なポートフォリオを提供します。

Freedom EVO NGSワークステーションでSureSelect XT Target Enrichment Systemを使用した48までのサンプルのパラレルプロセッシング用自動化プロトコルについて説明したアプリケーションノートをご覧になるには、こちらをクリックしてください。

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NimbleGen SeqCap EZライブラリ

Roche NimbleGenのSeqCap EZライブラリは、DNAシーケンシングライブラリからエクソーム全体または対象のカスタム領域の濃縮を可能にする溶液ベースのキャプチャーシステムです。SeqCap EZプロトコルは、Roche NimbleGenの仕様に従って、エクソームデザイン、遺伝子パネルおよびカスタムコンテンツデザインをカバーします。

NimbleGen SeqCap EZとKAPA™ HTPライブラリ調製をNimbleGen SeqCap Adapter Kits Aおよび/またはBと組み合わせるための自動化プロトコルについて説明したアプリケーションノートをご覧になるには、こちらをクリックしてください。プロトコルにより、96までのライブラリの調製と24までのライブラリツールのキャプチャーが可能になります。

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IonTorrent sequencing

Ion AmpliSeq™ライブラリ調製用検証済みの柔軟なプロトコル - Thermo Fisher Scientificと共同開発。

詳細を表示

Ion AmpliSeqライブラリおよびパネル

Ion AmpliSeqライブラリキット2.0では、シングルウェルでの12-25,000-plex PCR用NGSライブラリを素早く調製できます。

Freedom EVO NGSワークステーションでは、96までのサンプルの自動化されたライブラリ調製を10 ngのDNAまたはRNAを使用して6時間以内に実行できます。TouchToolsオペレーターインターフェースは、実作業時間とトレーニング要件を最小化し、プロトコル選択とワークテーブル設定の各段階でユーザーを導きます。

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Tab 03 / フレキシブルなNGSサンプル調製
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信頼性の高い次世代シーケンシング用に高品質のライブラリを作製するために、適切に行わなければならないことが非常にたくさんあります。

Freedom EVO NGS workstation をベースにしたNGS サンプル調製の自動化は、スループットと再現性を向上します。TouchTools™のグラフィカルインターフェースにより、プロトコルの選択やワークテーブルのセットアップ等それぞれの手順をガイドします。

Freedom EVO NGS workstation

Freedom EVO NGS workstationは、革新的なエアディスプレースメントテクノロジーを備え、(1)1,000 µlから0.5 µlまでの精度の高いピペッティングを可能にする8ピペットチャンネルを使用します。ワークステーションには(2)3台のInheco CPAC装置(酵素反応のための温調機能付き)、(3)Inheco Thermoshake温度制御付きシェーカー、(4)96ポジションマグネティックプレートセパレーター(Alpaqua 96S Super Magnet Plate)および(5)効率的なビーズのクリーンアップのためのロボット搬送アーム(RoMaが含まれます。また、コンパクトなワークテーブルは、長時間の自動運転用に(6)12箱までのチップボックスを格納できるスペースを備えています。

正確度: Freedom EVOの精密な自動化は、検証済みプロトコルにより、高品質の結果に必要な再現性を確保します。

柔軟性:バッチ要件による制約を受けません。6、13、19、40または96のサンプルを処理する必要がある場合でも、必要な分の運転しか要しないため試薬を節約します。

簡便さ:自動化の専門家である必要はありません。タッチスクリーンインターフェースを使用するとすぐにスタートできます。すぐにランをセットアップし、ワークフローに自信が持てます。

Freedom EVO NGS workstation

TouchToolsオペレーターインターフェース

TouchToolsアプリケーションのスタート画面で、オペレーターはワンタッチで目的のプロトコルを選択できます。

ステップごとのユーザー指示は、作業テーブルのセットアップ中に潜在的なエラーを回避し、正しい初期条件を確保するのに役立ちます。選択確認画面には、分析開始前の最終チェックとして概要が表示されるため、ラボにいる誰もが機器を簡単に使用できます。

設置とサポート

Freedom EVO NGSワークステーションには、水質検査とユーザートレーニングを含め、設置時に利用可能な標準プロトコルの1つが提供されます。追加プロトコルは、いつでもインストール可能です。

Tecan Journal記事

ライデン大学メディカルセンターは、Freedom EVO® NGSワークステーションを分子診断検査および臨床研究ワークフローに統合しました。この構成済みのソリューションを活用してセンターは新しいプロトコルを開発し、研究を実施するための柔軟性を持ちながら、日常の検査用のプラットフォームを素早く委託できました。(本文は英語です)

ノースキャロライナ大学(UNC)は、Freedom EVO®ワークステーション上での次世代シーケンシング用の主なサンプル調製プロトコルを自動化し、より効率的な処理を可能にしています。(本文は英語です)

トゥールーズ近隣のGeTゲノム施設は、IlluminaのTruSeq® DNAおよびRNAキット、および2台のFreedom EVO®ワークステーション上のBioo ScientificのNEXTflex™ PCR-Free Modulesを含め、Tecanと共同で自動NGSシリーズを開発し、広範囲のプロジェクトのためにスループットと信頼性の向上に役立てています。(本文は英語です)




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Tab 04 / 品質管理用インテグレーション
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NGSサンプル調製プロトコルでは、サンプル内で利用可能なDNAの定量およびサンプル内のフラグメントサイズ分布のレビューなど複数の品質管理の確認が必要です。

プレートリーダーのインテグレーション

DNA定量は、PicoGreen®またはQuantiFluor™などの蛍光染料でアリコートを測定すること、またはDNA全体のサンプルの吸光度を測定することで達成できます。DNA定量とノーマライゼーションワークフローには、以下のステップを含みます

  • 定量アッセイのセットアップ
  • リーダー内のDNA濃度の測定
  • 各ウェルの目標濃度を達成する希釈スキームの計算
  • 目的の濃度へのDNAサンプルの希釈

Fragment Analyzer INFINITY™のインテグレーション

Advanced AnalyticalのFragment Analyzer INFINITY(FAI)は、自動化されたマルチチャンネルキャピラリー電気泳動と、並列での96サンプルの高分解能分離を提供します。

50bp~50kbの核酸断片とスメアを区分して定量し、アプリケーションとサンプルの種類の間でシームレスに切り替えるための異なる2種類のゲル試薬を保持できます。

Infinite 200 PRO は、ワークステーションの横または、ワークテーブル下に配置できます。

ハードウェアおよびソフトウェアのインテグレーションに関する詳細な情報はこちらのテクニカルノートをご覧ください。




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Tab 05 / カタログ・資料
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カタログ

NGS 装置のスループットがますます高まり、より多くのサンプルのマルチプレックス化にともない、サンプル調製がボトルネックとなっています。NGSサンプル調製の自動化は、作業負荷を低減し、多くのサンプルの平行処理を行い、ライブラリ調製の再現性を向上させます。その一方でサンプル処理エラーを最小にします。

Fluentの画期的なデザインにより、ゲノムワークフローのスループットとスピードを向上します。 この革新的なソリューションは、高精度、ハイスループットそして自動運転を提供します。 少ない時間で多くの作業を確実に行うことができます。

アプリケーションノート

The automation of the Celero PCR Workflow with Enzymatic Fragmentation kit on the Freedom EVO NGS workstation provides a rapid, efficient and easy to run solution for the streamlined preparation of high quality sequencing-ready libraries.

Metagenomics is the study of genetic material extracted directly from environmental, veterinary or clinical samples, such as water, soil or stools....

Whole Genome Sequencing (WGS) offers the most comprehensive tool for the characterization of genomes. The automation of the Illumina Nextera DNA Flex library prep kit on the Freedom EVO NGS workstation provides a rapid, efficient and easy solution to prepare up to 96 high quality sequencing-ready libraries in a day.

Celero DNA-SeqキットとNuQuant®は、Illumina機器でのシーケンス用の正規ライブラリを生成する、革新的で合理化されたDNAライブラリ調製ワークフローです。(本文は英語です)

Illumina用NEBNext Ultra II Directional RNAライブラリ調製キットは、「dUTP」を使用して優れたリカバリー率を確保し、低品質のRNAからでさえ高品質のDirectionalライブラリを生成します。poly(A) mRNA濃縮には10 ng~1 µgのtotal RNA、rRNA除去には5 ng~1 µgと、幅広いインプット材料から96までのライブラリが同時に調製できます。(本文は英語です)

ターゲット濃縮は、特定のゲノム領域における変異の同定と分析のための次世代シーケンシング(NGS)のコストを削減して効率を向上し、臨床ゲノム研究などの有用なアプリケーションツールを提供します。(本文は英語です)

PCR製品のシーケンシングは、費用効果の高い変異型の同定とキャラクタリゼーションを提供するため、通常のテクニックとなりました。Freedom EVO NGSワークステーション上でのTruSeq Custom Amplicon Low Inputライブラリ調製ワークフローの自動化は、高速で効率的なソリューションを提供します。この設定により、わずか10 ngのゲノムDNAといったlow inputサンプルから高品質のライブラリを生成することができます。(本文は英語です)

96までのサンプルのカスタムパネルを使用して、6時間以下で実行する、遺伝性疾患およびがん研究用の高品質のIon AmpliSeqライブラリです。(本文は英語です)

NEBNext Ultra II DNAライブラリ調製ワークフローは、エンドリペアとdAテーリングステップを最小限のクリーンアップと組み合わせ、サンプル調製時間を削減します。機械的または酵素ベースの方法のどちらかで共有される500 pg~1 μgのインプットDNAに対応でき、1回の運転で96までのライブラリを調整します。(本文は英語です)

TruSeq Nano DNAの自動化された方法は、わずか200 ngから1 μgまでのDNAからの優れた品質のデータを生成します。これによって、腫瘍生検など、DNA利用が制約されるサンプルの研究を可能にし、貴重なサンプル材を将来使用するための保全に役立ちます。対照的に、TruSeq DNA PCRフリーライブラリ調製キットは、1~2 μgの開始量のDNAでより濃度の高いサンプルを提供する時間を節約する代替法を提供し、PCR由来のバイアスを排除することでカバレッジギャップを減らしてライブラリを生成し、ゲノムへのアクセスを拡大します。(本文は英語です)

IlluminaのNextera XT DNAライブラリ調製キットは、わずか1 ngからのDNAインプットのために最適化されたプロトコルを使用して、PCR amplicons、プラスミドおよびサイズの小さいゲノムから高品質のライブラリを効果的に構成できます。(本文は英語です)

HLA遺伝子シーケンシングは、血清型分析などの従来のテクニックと比較して、組織ドナーおよびレシピエントのHLAプロファイルの測定に優れているため、HLA遺伝子シーケンシングへの関心が高まっています。(本文は英語です)

IlluminaのTruSeqテクノロジーは、鎖遺伝子情報を提供し、あるRNA転写が由来するDNA鎖を同定します。この情報は、転写アノテーションへの信頼性を高め、配列可能な読み取り率を高め、究極的にはサンプルあたりのシーケンシングコストを削減します。このアプリケーションノートは、TruSeq RNAライブラリ調製キットの自動化について説明します。(本文は英語です)

Illumina Nextera Rapid Capture ExomeおよびExpanded Exomeキットは、高速でシンプルなオールインワン型サンプル調製とターゲット再シーケンシング試験におけるコーディング変異の同定のためのハイブリダイゼーションベースの濃縮プロセスを提供します。(本文は英語です)

AgilentのSureSelectXT Target Enrichment Systemは、ヒトおよびその他の種用エクソームキット、DNAおよびRNA両方のキャプチャー用カスタムキットの完全なポートフォリオを提供します。(本文は英語です)

Roche NimbleGenのSeqCap EZライブラリは、DNAシーケンシングライブラリからエクソーム全体または対象のカスタム領域の濃縮を可能にする溶液ベースのキャプチャーシステムです。SeqCap EZプロトコルは、Roche NimbleGenの仕様に従って、エクソームデザイン、遺伝子パネルおよびカスタムコンテンツデザインをカバーします。(本文は英語です)

ユーザーガイド

Freedom EVO® NGSワークステーション上でのIllumina®用NEBNext® UltraTM II Directional RNAライブラリ調製キット用ユーザーガイド

Illumina TruSeq Custom Amplicon Low Inputキット用ユーザーガイド

Tecan Freedom EVO® NGSワークステーションを使用したIon AmpliSeqライブラリ調製

NEBNext Ultra II DNAライブラリ調製キット用ユーザーガイド

Illumina TruSeq Nano DNAおよびTruSeq DNA PCRフリーライブラリ調製用ユーザーガイド

Nextera XT DNAライブラリ用ユーザーガイド

TruSight HLA v2 Sequencing Panelライブラリ調製用ユーザーガイド

Illumina TruSeq Stranded mRNAライブラリ調製用ユーザーガイド

Illumina TruSeq Stranded Total RNAライブラリ調製用ユーザーガイド

Illumina TruSeq RNA Accessライブラリ調製用ユーザーガイド

Illumina Nextera Rapid Captureライブラリ調製用ユーザーガイド

Agilent SureSelect XT Target Enrichment System用ユーザーガイド

NimbleGen SeqCap EZ Library SRとKAPA™ HTPライブラリ調製用ユーザーガイド

研究用途向けです。 診断目的にはご使用いただけません。